絕望篇的舞台在希望之峰學園的教室。集合了各個領域的超一流高中生,為了培育他們而設立的,政府公認的特權學園「私立希望之峰學園」。這所學園,存在著集中了超高校級的才能的「本科」,以及只要支付高額學費,就誰都可以進入的「預備學科」。不僅是才能,性格也獨具個性的本科77期生。
未來篇的舞台在未來機關的秘密基地,因苗木袒護「絕望殘黨」而被未來機關總部的成員懲處,不料一同遭到黑白熊監禁,進而進行「最後的互相殘殺」。手被手銬銬住,一段時間還會投入昏眠藥。而且在這之中還有「背叛者」存在,藉由大家昏睡時殺人。
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咲良田是個看似普通的城鎮,實際上半數居民都是擁有超能力並受到「管理局」約束的「能力者」。高一生淺井惠擁有記憶保持能力,春埼美空則擁有將時光倒帶三天的能力,兩人合作便能讓世界倒流回到三天前。某天他們收到了一名少女的委託:「請讓我的貓復活!」於是兩人為了救助貓咪,進行了「重啟」……
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